Die Organe der Stiftung sind der Stiftungsrat und der Vorstand sowie die Revisionsstelle.
Der Stiftungsrat setzt sich aus Personen aus der Wirtschaft und der Universität zusammen und versammelt sich ein Mal pro Jahr zu einer ordentlichen Sitzung. Die jährlich wiederkehrenden Traktanden der Stiftungsratssitzung sind die Genehmigung der Jahresrechnung und die Décharge-Erteilung an die Revisionsstelle sowie die Genehmigung des Jahresberichts.

Dem Stiftungsrat gehören an:

• Walter Thut (Präsident)
• Eveline Schaad (Vizepräsidentin)
• Prof. Dr.  Britta Engelhardt, Theodor Kocher Institut
• Prof. Dr. Christina Thurner, Institut für Theaterwissenschaft
• Prof. Dr. Markus Freitag, Institut für Politikwissenschaft
• Prof. Dr. Christoph von Ballmoos, Dept. für Chemie, Biochemie und Pharmazie

Diese Personen bilden zugleich auch den Vorstand.

Weiter gehören dem Stiftungsrat an:

• Samuel Haldemann, Rechtsanwalt
• Dr. Monika Jänicke
• Vizerektor:in Forschung der Universität Bern (vakant)

Die Statuten delegieren einzelne Aufgaben an den aus dem Kreis des Stiftungsrats bestellten Vorstand. Dieser trifft sich üblicherweise einmal jährlich zu einer Sitzung. Zu seinen Aufgaben gehören insbesondere die Beratung und der Entscheid über die eingegangenen Gesuche. Diese Beschlussfassung wird insbesondere von den folgenden vier Fachreferenten/innen vorbereitet:

• Philosophisch-Historische Fakultät und Theologische Fakultät: Prof. Dr. Christina Thurner
• Philosophisch-Humanwissenschaftliche Fakultät,
  Wirtschafts- und Sozialwissenschaftliche Fakultät und
  Rechtswissenschaftliche Fakultät: Prof. Dr. Markus Freitag
• Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät: Prof. Dr. Christoph von Ballmoos
• Medizinische Fakultät und Vetsuisse Fakultät: Prof. Dr. Britta Engelhardt